Dr. rer. nat. Janine-Denise Kopicki

Forschungsschwerpunkt

• native Massenspektrometrie zur Analyse von Proteinen, Protein–Protein-Interaktionen und Protein–Ligand-Interaktionen
• quantitative native MS zur Bestimmung von Bindungsaffinitäten
• Charakterisierung von MHC–Peptid-Komplexen, einschließlich Identifikation potenzieller T-Zell-Epitope (Entwicklung einer High-Throughput-Methode)
• Analyse von Antikörpern, Immunglobulinen, Glykoproteinen und vielfältigen Proteinen aus Kooperationsprojekten

Methoden & Ansätze

• Analyse von Proteinkomplexen unter nativen Bedingungen
• quantitative Workflows zur Untersuchung von Bindungen und Affinitäten
• native-MS-basiertes Screening von MHC–Peptid-Interaktionen (DE-Patent "Charakterisierung MHC-bindender Peptide mittels nativer Massenspektrometrie" eingereicht)

Expertise

• nativer Massenspektrometrie auf unterschiedlichen Instrumententypen
• Analyse eines breiten Spektrums immunrelevanter und strukturbiologisch interessanter Proteine
• Mitgründung der DGMS Young Scientist-Fachgruppe
• Postdoc-Vertretung am CSSB
• Betreuung von Bachelor- und Master-Studierenden
• Lehrerfahrung in Seminaren, Vorlesungen und Laborpraktika besonders im Bereich der Biochemie, Bioanalytik und allgemeinen Chemie
• SpecDigger_jdk, a python-based interactive spectrum analysis tool for mass spectrometry data