PD Dr. Alvaro Mallagaray de Benito

Forschungsschwerpunkt

• NMR-Spektroskopie und NMR-basierte Metabolomik
• Entwicklung hybrider quantitativer NMR-KI-Methoden zur Analyse biologischer Fluide
• Identifikation diagnostischer Glykoproteinmarker in klinischen Kohorten (z. B. Krebs, IBD, NASH, Parkinson-Erkrankung)
• Aufklärung funktioneller Mechanismen der Freisetzung, Bindung und Aufnahme von N-Glykanen durch Darm-Bacteroidota mittels koordinierter Endoglykosidasen und SusD-ähnlicher Enzyme
• Untersuchung molekularer Mechanismen der frühen Schritte viraler Infektionen mittels NMR (Norovirus, SARS-CoV-2 u. a.)

Methoden & Ansätze

• multidimensionale NMR-Spektroskopie in Lösung und NMR-basierte Glykobiologie
• quantitative Glykoproteinanalyse mittels neuartiger NMR-Methoden in Kombination mit KI
• selektive Isotopenmarkierung, Proteinexpression und -reinigung aus bakteriellen und mammalischen Zellen
• statistische Modellierung, Lineshape-Fitting und automatisierte Datenverarbeitung (Matlab-basierte Pipelines)
• Liganden- und proteinbasierte NMR-Spektroskopie, Epitop-Mapping, Liganden-Screening und NMR-Analyse komplexer Glykane

Expertise

• Entwicklung und Anwendung von NMR-Methoden für Metabolomik und Glykoproteinanalytik
• computational NMR: Spektrenverarbeitung, Quantifizierung und statistische Auswertung; Biomarkerforschung in biomedizinischen und klinischen Kontexten
• Proteinexpression und -reinigung aus bakteriellen und mammalischen Zellsystemen
• Glykobiologie und Virologie im Kontext der Glykankennung
• Untersuchung von Enzymkinetik und Enzymaktivität mittels NMR